פעולת שסתומי השער דומה במובנים רבים לפעולת רוב השסתומים. גלגל היד או המפעיל נשלט כדי לסובב את הגבעול, השולט בשער. עבור גלגל היד, הגלגל מסובב במספר סיבובים לפני שניתן יהיה לפתוח את שסתום השער באופן מלא ממצב סגור או לסגור לחלוטין ממצב פתוח.
השליטה באמצעות המפעיל קלה יותר מכיוון שהיא לא דורשת משתמש במקום, רק מערכת מפעיל (פניאומטית או חשמלית) חייבת להיות באתר. על ידי הרמת השער למצב פתוח לחלוטין, השסתום מאפשר לחומר לזרום דרך הצינור ללא הפרעה.
סגירה ואיטום של הצינור למושב השסתום שומרת על לחץ הזרימה ומגבילה את זרימת המדיה מעבר לשער. קצב הזרימה של המדיה חווה שינוי לא יציב כאשר שסתום השער סגור, וכתוצאה מכך יחס בלתי צפוי בין השסתום לקצב זרימת הנוזל.
לחץ וזרימת הנוזלים כנגד השער שוחקים את המושב והשער. אין להשתמש בשסתומי שער לוויסות זרימה מכיוון שהזרימה הקבועה מזרזת את הנזק לשער ולמושב.